Laboratoire de biochimie (Bicêtre)

Laboratoire de biochimie (Bicêtre)

Le laboratoire de Biochimie de Bicêtre a une activité spécialisée centrée sur le diagnostic biochimique et moléculaire des maladies héréditaires du métabolisme énergétique avec atteinte hépatique et/ou neuromusculaire.  Son approche va du phénotype (caractères observables d’un individu) au génotype (composition génétique d’un individu) : elle s’appuie sur des tests d’orientation spécifiques, des mesures d’activités enzymatiques sur des cellules ou des tissus et une confirmation du déficit par une analyse moléculaire du ou des gènes impliqués dans le déficit enzymatique.
La recherche directe de mutation a permis de  remplacer certains diagnostics enzymatiques invasifs (biopsies de foie pour le diagnostic des fructosémies congénitales), ou d’étudier la composante « transporteur » impliquée dans les cholestases héréditaires (gènes MDR3, FIC1, BSEP) peu abordable par une étude fonctionnelle in vitro. Un laboratoire de culture cellulaire vient compléter le secteur enzymologie et la plateforme de biologie moléculaire.
Le laboratoire est composé de biologistes médicaux (Audrey Bouton, Anne Davit Spraul, Abdel Slama, Pauline Gaignard et Elise Lebigot), 4 techniciens pour le secteur enzymologie, 3 techniciens pour les cultures cellulaires et 3 techniciens en biologie moléculaire.
Les pathologies concernées 
  • Anomalies mitochondriales : anomalies du carrefour du pyruvate, anomalies du cycle de Krebs, déficit de la chaine respiratoire, anomalies de la betaoxydation des acides gras.
  • Anomalies du métabolisme des sucres : galactose, fructose et  glycogénoses hépatiques
  • Anomalies du métabolisme de la tyrosine : tyrosinémie de type I
  • Anomalies de transporteurs biliaires : cholestases héréditaires (PFIC, CNN, ICP, LPAC …)
Technologies utilisées
  • Polarographie, Spectrophotométrie, spectrofluorimétrie, LC-MSMS,
  • Western blot, utilisation de substrats radiomarqués  C14 et H3
  • Cultures cellulaires : fibroblastes, cellules fœtales
  • Séquençage Sanger, qPCR, NGS (séquençage nouvelle génération)
Publications
Davit-Spraul A, Fabre M, Branchereau S, Baussan C, Gonzales E, Stieger B, Bernard O, Jacquemin E  ATP8B1 and ABCB11 analysis in 62 children with normal GGT PFIC: phenotypic differences between PFIC1 and PFIC2 and natural history. Hepatology 2010;51:1645-1655
Gaignard P, Gonzales E, Ackermann O, Labrune P, Correia I, Therond P, Jacquemin E, Slama A.Mitochondrial Infantile Liver Disease due to TRMU Gene Mutations: Three New Cases.JIMD Rep. 2013;11:117-23.
Boutron A, Marabotti A, Facchiano A, Cheillan D, Zater M, Oliveira C, Costa C, Labrune P, Brivet M; French Galactosemia Working Group.Mutation spectrum in the French cohort of galactosemic patients and structural simulation of 27 novel missense variations. Mol Genet Metab. 2012 Nov;107(3):438-47.